Liharotuisten nautojen genotyypityspalvelu

Short description

Hankinnan tarkoitus on tuottaa liharotuisten nautojen genotyypityspalvelua Satafood Kehittämisyhdistys ry:n hallinnoimaan Emolehmätilojen eläinaineksen kehittämishankkeeseen (Hankenumero: 128214). Emolehmätilojen eläinaineksen kehittämishankkeessa pyritään tilakohtaista neuvontaa, tutkimustuloksia ja mittauksia hyödyntämällä parantamaan emolehmätilojen eläinaineksen tasoa ja kestävyyttä. Hankkeen yhtenä osa-alueena on kerätä genominäytteitä, joiden tulokset ovat käytettävissä liharotuisten nautojen genomisten jalostusarvojen vertailuryhmäaineistossa. Emolehmätilojen eläinaineksen kehittämishanke on alueiden välinen kehittämis- ja tiedonhankintahanke. Hankkeen toteutusalue on Häme, Pirkanmaa, Satakunta, Uusimaa ja Varsinais-Suomi.

Hankinnan tavoitteena on tutkia genotyypityspalvelulla yhteensä 3000 näytettä. Genotyypitystulokset näistä näytteistä voidaan käyttää genomisten jalostusarvojen muodostamiseen suomalaisille liharotuisille naudoille.

Hankinnan tekijät ovat:
1) Osallistuminen genotyypitettävien eläinten valintaan hanketiloilla
2) Tarvittavien näytteenottovälineiden toimitushanketiloille
3) Lihakarjatilojen ottamien genotyypitysnäytteiden vastaanottaminen ja toimittaminen genotyypityslaboratorioon
4) Genotyypitysnäytteisiin yhdistettävien eläimen polveutumistietojen (eläimen vanhempais- ja jälkeläistiedot) toimittaminen nautojen pohjoismaisesta jalostusarvostelusta vastaavan Nordisk Avelsvärdering-organisaation (NAV) tietokantaan. Sekä eläimen oma identti että polveutumistiedot on oltava kansainvälisessä muodossa
5) Nautojen genomin tutkimukseen on käytettävä soveltuvaa Bovine SNP Beadchip sirua, jossa on vähintään 50000 liharotuisten nautojen genomin tutkimiseen soveltuvaa SNP-merkkiä
6) Sirulla on oltava ICAR:n suositusten mukainen 200 SNP-merkin paneeli polveutumismäärityksiin (https://www.icar.org)
Hankinnan tarkoitus on tuottaa liharotuisten nautojen genotyypityspalvelua Satafood Kehittämisyhdistys ry:n hallinnoimaan Emolehmätilojen eläinaineksen kehittämishankkeeseen (Hankenumero: 128214). Emolehmätilojen eläinaineksen kehittämishankkeessa pyritään tilakohtaista neuvontaa, tutkimustuloksia ja mittauksia hyödyntämällä parantamaan emolehmätilojen eläinaineksen tasoa ja kestävyyttä. Hankkeen yhtenä osa-alueena on kerätä genominäytteitä, joita voidaan käyttää liharotuisten nautojen genomisten jalostusarvojen vertailuryhmään. Emolehmätilojen eläinaineksen kehittämishanke on alueiden välinen kehittämis- ja tiedonhankintahanke. Hankkeen toteutusalue on Häme, Pirkanmaa, Satakunta, Uusimaa ja Varsinais-Suomi.

Hankinnan tavoitteena on tutkia genotyypityspalvelulla yhteensä 3000 näytettä. Genotyypitystulokset näistä näytteistä voidaan käyttää genomisten jalostusarvojen muodostamiseen suomalaisille liharotuisille naudoille. Genomisten jalostusarvojen rakentaminen on olennainen osa suomalaisten emolehmätilojen eläinaineksen kehittämiseen vaadittavia toimenpiteitä. Lihakarjan genomisten jalostusarvojen kehitystyö tehdään Luonnonvarakeskuksen hallinnoimassa BeefGeno-hankkeessa.

Palvelun tarjoajalta edellytetään:
1) Osallistuminen genotyypitettävien eläinten valintaan hanketiloilla
2) Tarvittavien näytteenottotarvikkeiden toimittaminen hanketiloille. Genomimäärityksessä voidaan käyttää näytteitä, jotka on otettu kudosnäytteinä korvamerkinnän yhteydessä, karvanäytteenä, verinäytteenä tai siemennesteenä
3) Lihakarjatilojen ottamien genotyypitysnäytteiden vastaanottaminen ja toimittaminen genotyypityslaboratorioon
4) Genotyypitysnäytteisiin yhdistettävien eläimen polveutumistietojen (eläimen vanhempais- ja jälkeläistiedot) toimittaminen nautojen pohjoismaisesta jalostusarvostelupalvelusta vastaavan Nordisk Avelsvärdering-organisaatioon (NAV) tietokantaan. Sekä eläimen oma identti että polveutumistiedot on oltava kansainvälisessä muodossa

Vaatimukset genotyypityksessä käytettävälle DNA-sirulle:
1) Genotyypityksessä on käytettävä nautojen genoin tutkimukseen soveltuvaa Bovine SNP Beadchip, jossa on vähintään 50000 liharotuisten nautojen genomin tutkimiseen soveltuvaa SNP-merkkiä
Esimerkkeinä soveltuvista DNA-siruista:
* Eurogenomics-ryhmän kehittämä EURO G MD v1 (84K)
* ICBF's IDB v4
* Weathersbys Scientefitic Bovine VersaSNP 50K
* Illumina Bovine 54K

Tarjoajan tulee ilmoittaa genotyypityspalvelun hinta e/näyte. Tarjotun hinnan tulee kattaa kaikki palvelun tuottamiseen liittyvät kustannukset. Hinnat ilmoitetaan tarjouksen yhteydessä ilman arvonlisäveroa. Arvonlisävero laskutetaan palvelun suorituksen yhteydessä voimassa olevan lainsäädännön mukaisesti.

Tarjouskilpailussa ei ole hyväksyttävää tehdä vaihtoehtoisia tarjouksia.

Jos tarjoaja käyttää alihankkijoita hankinnan toteuttamisessa, tarjoajan tulee ilmoittaa tarjouksessaan, minkä osan hankinnasta tarjoaja antaa alihankkijoiden suoritettavaksi ja tarjoajan tulee tarjouksessaan nimetä alihankkijat.

Tarjoajan tulee tehdä tarjouksensa tämän tarjouspyynnön mukaisesti. Tarjouksen sisällön ja ehtojen tulee olla tämän tarjouspyynnön mukaiset.

Hankintayksikkö ei peri korvausta tarjousasiakirjoista eikä maksa korvausta tarjouksen laskennasta ja laatimisesta.

Tarjous tulee pyrkiä laatimaan siten, että tarjous ei sisällä viranomaisten toiminnan julkisuudesta annetussa laissa (621/1999) tarkoitettuja liike- eikä ammattisalaisuuksia. Mikäli tarjoajan on välttämätöntä sisällyttää tarjoukseensa liike- tai ammattisalaisuuksia, tarjoajan tulee yksilöidä nämä tiedot. Tarjous kokonaisuutena ei voi olla liike- tai ammattisalaisuus tai luottamuksellinen. Tarjoajan tulee ilmoittaa tarjouksessaan perustelu sille, minkä vuoksi tarjoaja katsoo jonkin tiedon olevan liike- tai ammattisalaisuus. Tarjousten vertailussa käytetyt tiedot eivät voi olla tarjoajien kesken salassa pidettäviä, vaan ne ovat tarjoajien kesken asianosaisjulkisia tietoja. Antaessaan tarjouksen tarjoaja hyväksyy tämän tiedon.

Sopimus hankintayksikön ja valitun tarjoajan välille syntyy kirjallisen hankintasopimuksen allekirjoituksella.

Hankittavan palvelun minimikriteerinä genotyypitysnäytteiden ottamiseen ja lähettämiseen liittyen on:
* suomenkielinen palvelu

Satafood Kehittämisyhdistys ry pidättää itsellään oikeuden olla hyväksymättä mitään annetuista tarjouksista. Satafood Kehittämisyhdistys ry:llä on oikeus hylätä tarjouspyyntöä vastaamattomat ja puutteelliset tarjoukset. Myöhästyneitä tarjouksia ei oteta huomioon.

Osallistumisvaatimukset

Ehdokkaiden tai tarjoajien soveltuvuutta koskevat vaatimukset