Bystyremelding 3/2003, om Grønn kommune, sier at alle større tekniske etater og/eller etater med miljø som hovedarbeidsområde skal sertifiseres i.h.h.t. ISO 14001-standarden. Dette omfatter følgelig Bymiljøetaten.
Bymiljøetaten skal anskaffe et akkreditert sertifiseringsorgan til å forestå miljøsertifisering i.h.h.t. ISO 14001 for alle deler av etatens virksomhet, med unntak av Skogsdriften (Skogsdriften er allerede sertifisert i.h.h.t. fagstandarden Norsk PEFC Skogstandard, gjennom Norsk Skogsertifisering). Bymiljøetaten ble første gang sertifisert i desember 2013, og ble resertifisert i 2016 og 2019.
Resertifisering og årlig oppfølging i sertifikatets varighet gjelder fra kontraktsinngåelse i 2022 t.o.m. 31.12.2024.